As quatro estações do ano são bem definidas e  inversas ao Brasil.
O extremo norte é a região mais fria, com clima sub-ártico. Nos invernos mais rigorosos, o acúmulo de neve muitas vezes prejudica os acessos aos pontos turísticos. Em compensação, em outras épocas do ano, a paisagem se torna deslumbrante.
Em Tóquio, região central do Japão, os verões são quentes e úmidos, enquanto os invernos são frios.

Nos períodos da primavera e outono as temperaturas são agradáveis e são os meses mais procurados pelos turistas.
No sul, a região de Kyushu e a ilha de Okinawa, os verões são quentes com temperaturas médias de 30ºC e invernos amenos, com temperaturas que chegam a mínima de 10ºC. Os passeios são agradáveis em qualquer época do ano.
O período de maior intensidade de chuvas ocorre de junho a meados de julho.